מסוף מטענים, או בלועזית Cargo Terminal, הוא מתחם לוגיסטי ייעודי שבו מתבצע הטיפול המרכזי בסחורות המגיעות או יוצאות מישראל במסגרת סחר בינלאומי.
המסוף משמש נקודת מעבר בין אמצעי ההובלה השונים, כגון אוניות, מטוסים, רכבות ומשאיות, והוא המקום שבו המטען נקלט, נרשם ומוכן להמשך דרכו.
במסוף מטענים מתבצעות פעולות תפעוליות ורגולטוריות חיוניות, ובהן ניטול מטענים, אחסון זמני, בדיקות מכס ובטיחות, טיפול במסמכים ותיאום מול רשויות, מובילים, משלחים ועמילי מכס.
במטענים מסוימים נעזרים גם בחברת מניה, המבצעת ספירה, רישום ובקרה של המטען במהלך פעולות הטעינה והפריקה.
במקרים שבהם המטען נפרק מכלי השיט ומועבר תחילה לשטח אחסון בנמל לפני איסופו על ידי המוביל, התהליך מכונה מסירה עקיפה.
כאשר מטען נותר במסוף ללא דרישה או שחרור בפרק הזמן הקבוע, הוא עשוי להיחשב סחורה בלתי נדרשת ולהיות מטופל בהתאם לנהלי המכס.
המסופים פועלים בסמיכות לנמלים ימיים, לשדות תעופה ולמעברי גבול, ומופעלים באמצעות מערכות מידע, ציוד ייעודי וצוותים מקצועיים הפועלים לפי נהלים ותקנים מחייבים.
במקרים של סחורות רגישות או ייעודיות, מסוף המטענים עשוי להיות מתקן מתמחה, כגון טרמינל קפה, המותאם לטיפול ואחסון של קפה ירוק.
במסופי מכולות, חלק מרכזי מהפעילות מנוהל באמצעות מערכת TOS, המשמשת לתכנון ובקרה של פריקה, טעינה, אחסון, תנועת מכולות ותפעול שערים.
דוגמה מרכזית למסוף מטענים בישראל היא מסוף ממן, הפועל בנמל התעופה בן-גוריון ומטפל בעיקר במטעני יבוא ויצוא אוויריים.
בהקשר של יבוא, מסוף המטענים מהווה חוליה מרכזית בשרשרת האספקה, שכן אופן ההתנהלות בו משפיע ישירות על זמני השחרור, העלויות המקומיות ויעילות תהליך היבוא כולו.
היערכות נכונה לפעילות במסוף והבנת תפקידו מאפשרות צמצום עיכובים, שליטה טובה יותר בעלויות וניהול תקין של זרימת הסחורות.